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環(huán)境微生物學(xué)名詞解釋
微生物：肉眼看不見的、必須自電子顯微鏡或光學(xué)顯微鏡下才能看見的所有微小生物的統(tǒng)稱。
病毒：沒有細(xì)胞結(jié)構(gòu)，專性寄生在活的敏感宿主體內(nèi)的超微小生物。他們只具有簡單的獨(dú)特結(jié)構(gòu)，可通過細(xì)菌過濾器。
蛋白質(zhì)衣殼：由一定數(shù)量的衣殼粒（由一種或幾種多肽鏈折疊而成的蛋白質(zhì)亞單位）按一定的排列組合構(gòu)成的病毒外殼。
核酸內(nèi)芯：即核糖核酸（RNA）和脫氧核糖核酸（DNA）
裝配：借用宿主細(xì)胞的合成機(jī)構(gòu)復(fù)制核酸，進(jìn)而合成噬菌體的蛋白質(zhì)，核酸和蛋白質(zhì)聚集合成新的噬菌體。 毒性噬菌體：侵入宿主細(xì)胞后，隨即引起宿主細(xì)胞裂解的噬菌體
溫和噬菌體：不引起宿主細(xì)胞裂解的噬菌體（當(dāng)它侵入宿主細(xì)胞后，其核酸附著并整合在宿主染色體上，和宿主的核酸共同復(fù)制，宿主細(xì)胞不裂解而繼續(xù)生長。）
溶原細(xì)胞：含有溫和噬菌體核酸的宿主細(xì)胞（溶原性是遺傳特性）
原噬菌體（或前噬菌體）：溶原細(xì)胞內(nèi)的溫和噬菌體核酸
噬菌斑：原代或傳代單層細(xì)胞被病毒感染后，一個個細(xì)胞被病毒蝕空成空斑（亦稱蝕斑）。
PFU：病毒空斑單位——單位體積內(nèi)含有病毒數(shù)：ηPFU=（n瓶內(nèi)空斑平均數(shù)*病毒稀釋度）/每瓶的病毒接種數(shù) 原核微生物：無核膜包被，只有稱作核區(qū)的裸露DNA的原始微生物。
極端微生物（亦叫嗜極微生物）：喜在極端惡劣環(huán)境中生活的微生物。組要包括嗜酸菌、嗜鹽菌、嗜熱菌、嗜冷菌及嗜壓菌等。
細(xì)胞壁：包圍在細(xì)菌體表最外層的、堅(jiān)韌而有彈性的薄膜。
原生質(zhì)體：包括細(xì)胞質(zhì)膜（原生質(zhì)膜）、細(xì)胞質(zhì)及內(nèi)含物、擬核。
細(xì)胞質(zhì)膜：緊貼在細(xì)胞壁的內(nèi)側(cè)而包圍細(xì)胞質(zhì)的一層柔軟而富有彈性的薄膜。是半滲透膜。
核糖體：原核微生物的核糖體是分散在細(xì)胞質(zhì)中的亞微顆粒，是合成蛋白質(zhì)的部位。
內(nèi)含顆粒：細(xì)菌生長到成熟階段，因營養(yǎng)過剩形成的一些貯藏顆粒。
莢膜：一些細(xì)菌在其細(xì)胞表面分泌的一種把細(xì)胞壁完全包圍封住的黏性物質(zhì)。
黏液層：有些細(xì)菌不產(chǎn)莢膜，其細(xì)胞表面仍可分泌黏性的多糖，疏松地附著在細(xì)菌細(xì)胞壁表面上，與外界沒有明顯邊緣。
菌膠團(tuán)：有些細(xì)菌由于其遺傳特性決定，細(xì)菌之間按一定得排列方式互相黏集在一起，被一個公共莢膜包圍形成一定形狀的細(xì)菌集團(tuán)。（一定要先形成莢膜、黏液層才能黏成菌膠團(tuán)）
衣鞘：絲狀體表面的黏液層或莢膜硬質(zhì)化，形成一個透明空韌的空殼。（水生境中的絲狀菌多數(shù)有衣鞘）
芽孢：某些細(xì)菌在它的生活史中某一個階段或某些細(xì)菌在它遇到外界不良環(huán)境時，在其細(xì)胞內(nèi)形成的一個內(nèi)生孢子。（抗逆性休眠體，是細(xì)菌的分類鑒定依據(jù)之一）
鞭毛：由細(xì)胞質(zhì)膜上的鞭毛基粒長出穿過細(xì)胞壁伸向體外的一條纖細(xì)的波浪狀絲狀物。
菌落：由一個細(xì)菌繁殖起來的，由無數(shù)細(xì)菌組成具有一定形態(tài)特征的細(xì)菌集團(tuán)。
菌落特征：細(xì)菌在固體培養(yǎng)基上的培養(yǎng)特征。
光滑型菌落：具有莢膜，表面光滑、濕潤、黏稠的菌落。
粗糙型菌落：不具有莢膜，表面干燥、皺褶、平坦的菌落。
菌苔：細(xì)菌在斜面培養(yǎng)基接種線上長成的一片密集的細(xì)菌群落。
真核微生物：有發(fā)育完好的細(xì)胞核，有高度分化的細(xì)胞器，進(jìn)行有絲分-裂的微生物。
原生動物：動物中最原始、最低等、結(jié)構(gòu)最簡單的單細(xì)胞動物。
全動性營養(yǎng)：全動性營養(yǎng)的原生動物以其他生物（如細(xì)菌、放線菌、酵母菌、霉菌、藻類、比自身小的原聲動物和有機(jī)顆粒）為食。
植物性營養(yǎng)：有色素的原生動物，在有光照的條件下，吸收CO2和無機(jī)鹽進(jìn)行光合作用，合成有機(jī)物供自身營養(yǎng)。 腐生性營養(yǎng)：某些無色鞭毛蟲和寄生的原生動物，借助體表的原生質(zhì)膜吸收環(huán)境和寄主中的可溶性有機(jī)物作為營養(yǎng)。 胞囊：若環(huán)境條件變壞，如水干涸、水溫、pH過高或過低，溶解氧不足，缺乏食物或排泄物積累過多，污水中的有機(jī)物濃度超過原生動物的適應(yīng)能力等情況，都可使原生動物不能正常生活而形成胞囊。胞囊是抵抗不良環(huán)境的一種休眠體。
微型后生動物：原生動物以外的多細(xì)胞動物叫后生動物，有些后生動物形體微小，要借助光學(xué)顯微鏡看清，故稱為后生動物。
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酶：由細(xì)胞產(chǎn)生的、能在體內(nèi)或體外起催化作用的一類具有活性中心和特殊構(gòu)象的生物大分子，包括蛋白質(zhì)類酶和核酸類酶。
輔基和輔酶：酶中非蛋白質(zhì)成分可以是不含氮的小分子有機(jī)物，或者是由不含氮的小分子有機(jī)物和金屬離子組成，把它分為輔基和輔酶，其中與酶蛋白結(jié)合緊的，稱為輔基；與酶蛋白結(jié)合得不緊的，成為輔酶。
酶的活性中心：酶的活性部位，是酶蛋白分子中直接參與和底物結(jié)合，并與酶催化作用直接有關(guān)的部位。
新陳代謝（物質(zhì)代謝）：微生物從外界環(huán)境中不斷攝取營養(yǎng)物質(zhì)，經(jīng)過一系列生物化學(xué)反應(yīng)，轉(zhuǎn)變成細(xì)胞的組分，同時產(chǎn)生廢物并排泄到體外的微生物與環(huán)境之間的物質(zhì)交換過程。新陳代謝是活細(xì)胞中進(jìn)行的所有化學(xué)反應(yīng)的總稱，是生物最基本的特征之一。
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營養(yǎng)：生物體從外部環(huán)境中攝取其生命活動所必需的能量和物質(zhì)，以滿足正常生長繁殖需要的一種最基本的生理功能。
碳源：凡能供給微生物碳素營養(yǎng)的物質(zhì)。 能源：能為微生物生命活動提供最初能量來源的營養(yǎng)物或輻射能。
培養(yǎng)基：根據(jù)各種微生物對營養(yǎng)的需要，按一定的比例配制而成的，用以培養(yǎng)微生物的基質(zhì)，稱為培養(yǎng)基。 合成培養(yǎng)基：按微生物的營養(yǎng)要求，用已知的化合物配制而成的培養(yǎng)基。
天然培養(yǎng)基：天然有機(jī)物配制而成的培養(yǎng)基叫天然培養(yǎng)基。
復(fù)合培養(yǎng)基：又稱半合成培養(yǎng)基，是一類既有一致的化學(xué)組成物質(zhì)，同時加有某些天然成分而配制的培養(yǎng)基。 選擇培養(yǎng)基：根據(jù)某微生物的特殊營養(yǎng)要求或?qū)Ω鞣N化學(xué)物質(zhì)敏感程度的差異而設(shè)計(jì)、配制的培養(yǎng)基。
鑒別培養(yǎng)基：幾種細(xì)菌由于對培養(yǎng)基中某一成分的分解能力不同，其菌落通過指示劑顯示出不同的顏色而被區(qū)分開，這種起鑒別和區(qū)分不同細(xì)菌作用的培養(yǎng)基稱為鑒別培養(yǎng)基。
加富（富集）培養(yǎng)基：用特別的物質(zhì)或成分促使微生物快速生長，這種用特別物質(zhì)或成分配制而成的培養(yǎng)基，稱為加富培養(yǎng)基。
主動運(yùn)輸：需要能量和滲透酶的逆濃度梯度積累營養(yǎng)物質(zhì)的過程。
基團(tuán)轉(zhuǎn)位：是存在于某些原核生物中的運(yùn)輸方式。與主動運(yùn)輸相比，主要用于糖的運(yùn)輸，運(yùn)輸總效果與主動運(yùn)輸相似，可以逆濃度梯度將營養(yǎng)物質(zhì)移向細(xì)胞內(nèi)，結(jié)果使細(xì)胞內(nèi)結(jié)構(gòu)發(fā)生變化的物質(zhì)濃度大大超過為改變結(jié)構(gòu)的同類物質(zhì)的濃度。
基質(zhì)（底物）水平磷酸化：微生物在基質(zhì)氧化過程中，可形成多種含高自由能的中間產(chǎn)物，中間體將高能鍵（～）交給ADP，使ADP磷酸化而生成ATP。此過程中底物的氧化和磷酸化反應(yīng)相偶聯(lián)并生成ATP，成為底物水平磷酸化。 氧化磷酸化：微生物在好氧呼吸和無氧呼吸時，通過電子傳遞體系產(chǎn)生ATP的過程叫氧化磷酸化。其遞氫（電子）和受氫過程與磷酸化反應(yīng)相偶聯(lián)，并產(chǎn)生ATP。
光合磷酸化：光引起葉綠素、菌綠素或菌紫素逐出電子，通過電子傳遞產(chǎn)生ATP的過程叫做光合磷酸化。不產(chǎn)氧的光合細(xì)菌通過環(huán)式光合磷酸化合成ATP，產(chǎn)氧的為非環(huán)式。
發(fā)酵：指在無外在電子受體時，底物脫氫后所產(chǎn)生的還原氫[H]不經(jīng)呼吸鏈傳遞而直接交給某一內(nèi)源性中間產(chǎn)物接受，以實(shí)現(xiàn)底物水平磷酸化產(chǎn)能的一類生物氧化反應(yīng)。
好氧呼吸：有外在最終電子受體（O2）存在時，對底物（能源）的氧化過程。
無氧呼吸：又稱厭氧呼吸，是一類電子傳遞體系末端的受氫體為外源無機(jī)氧化物的生物氧化。
脫氮作用：硝酸鹽的NO3-在接受電子后變成NO2-、N2的過程，叫脫氮作用，也叫反硝化作用或硝酸鹽還原作用。 光合作用：光合生物通過光合作用將光能轉(zhuǎn)化為化學(xué)能，并通過食物鏈為生物圈其他成員所利用。是地球上進(jìn)行的最大的有機(jī)合成反應(yīng)。
生長：正常情況下，同化作用大于異化作用，微生物的細(xì)胞質(zhì)量不斷迅速增長，稱為生長。
裂殖：當(dāng)單細(xì)胞個體生長到一定程度時，由一個親代細(xì)胞分-裂為兩個大小、形狀與親代細(xì)胞相似的子代細(xì)胞，使得個體數(shù)目增加。
發(fā)育：微生物從生長到繁殖這個由量變到質(zhì)變的過程叫做發(fā)育。
代時（世代時間）：細(xì)菌兩次細(xì)胞分-裂之間的時間。
分批培養(yǎng)：將一定量的微生物接種在一個封閉的、盛有一定體積液體培養(yǎng)基的容器內(nèi)，保持一定的溫度、pH和溶解氧量，微生物在其中生長繁殖。
恒濁連續(xù)培養(yǎng)：使細(xì)菌培養(yǎng)液的濃度恒定，以濁度為控制指標(biāo)的培養(yǎng)方式。
恒化連續(xù)培養(yǎng)：維持進(jìn)水中的營養(yǎng)成分恒定（其中對細(xì)菌生長有限制作用的成分要保持低濃度水平），以恒定流速
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進(jìn)水，以相同流速流出代謝產(chǎn)物，使細(xì)菌處于最高生長速率狀態(tài)下生長的培養(yǎng)方式。
滅菌：通過超高溫或其他物理、化學(xué)方法將所有微生物的營養(yǎng)細(xì)胞和所有芽孢或孢子全部殺死的過程。滅菌方法有干熱滅菌法和濕熱滅菌法。
消毒：用物理、化學(xué)方法殺死致病菌（有芽孢和無芽孢的細(xì)菌），或者殺死所有微生物的營養(yǎng)細(xì)胞和一部分芽孢。消毒法有巴斯的消毒法和煮沸消毒法兩種。
微生物與微生物之間的關(guān)系：
競爭關(guān)系：不同的微生物種群在同一環(huán)境中，對食物等營養(yǎng)、溶解氧、空間和其他共同要求的物質(zhì)相互競爭，互相受到不利影響。
原始合作關(guān)系（或稱原始共生、互生）：兩種可以單獨(dú)生活的生物共存于同一環(huán)境中，相互提供營養(yǎng)及其他生活條件，雙方互為有利，相互受益。兩者分開始各自可單獨(dú)生存。
共生關(guān)系：兩種不能單獨(dú)生活的微生物共同生活于同一環(huán)境中，各自執(zhí)行優(yōu)勢的生理功能，在營養(yǎng)上互為有利而所組成的共生體，這兩者之間的關(guān)系就叫共生關(guān)系。
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偏害關(guān)系（拮抗關(guān)系）：共存于同一環(huán)境的兩種微生物，甲方對乙方有害，乙方對甲方無任何影響。分為非特異性偏害和特異性偏害。
捕食關(guān)系
寄生關(guān)系：一種生物需要在另一種生物體內(nèi)生活，從中攝取營養(yǎng)才得以生長繁殖。寄生的結(jié)果一般都會引起寄主的損傷或死亡。（專性寄生：不能離開寄主生存；兼性寄生：離開寄主后能營腐生生活）
生態(tài)：生物與環(huán)境的關(guān)系。
生態(tài)系統(tǒng)：在一定時間和空間范圍內(nèi)由生物與他們的生境通過能量流動和物質(zhì)循環(huán)所組成的一個自然體，簡稱生態(tài)系，可用公式表示：生態(tài)系統(tǒng)=生物群落+環(huán)境條件
生態(tài)平衡：生態(tài)系統(tǒng)是開放系統(tǒng)，當(dāng)能量和物質(zhì)的輸入輸出嬌嬌長時間趨于相等，生態(tài)系統(tǒng)的組成、結(jié)構(gòu)和功能將長期處于穩(wěn)定狀態(tài)。即使有外來干擾，生態(tài)系統(tǒng)一般也能通過自行調(diào)節(jié)的能力恢復(fù)到原來的穩(wěn)定狀態(tài)，這就是生態(tài)系統(tǒng)的平衡，即生態(tài)平衡。
土壤自凈：土壤對施入一定負(fù)荷的有機(jī)物或有機(jī)污染物具有吸附和生物降解的能力，通過各種物理、化學(xué)過程自動分解污染物使土壤恢復(fù)到原有水平的凈化過程，稱為土壤自凈。
土壤生物修復(fù)：利用土壤中天然的微生物資源或人為投加目的菌株，甚至用構(gòu)建的特異降解功能菌投加到各污染土壤中，將滯留的污染物快速降解和轉(zhuǎn)化，恢復(fù)土壤的天然功能。
水體自凈：河流接納了一定量的有機(jī)污染物后，在物理的、化學(xué)的和水生物等因素的綜合作用后得到凈化，水質(zhì)恢復(fù)到污染前的水平和狀態(tài)，這叫做水體自凈。
水體富營養(yǎng)化：由于某些因素，尤其是人類將富含氮、磷的城市生活污水和工業(yè)廢水排放入湖泊、河流和海洋，使水體的氮、磷營養(yǎng)過剩，促使水體中藻類過量生長，使淡水水體發(fā)生水華，是海洋發(fā)生赤潮，造成水體富營養(yǎng)化。 好氧活性污泥：由多種多樣的好氧微生物和兼性厭氧微生物（兼有少量的厭氧微生物）與污（廢）水中有機(jī)和無機(jī)固體物質(zhì)混凝交織在一起，形成的絮狀體或稱絨粒。
好氧生物膜：由多種多樣的好氧微生物和兼性厭氧微生物黏附在生物濾池濾料上或黏附在生物轉(zhuǎn)盤盤片上的一層黏性、薄膜狀的微生物混合群體。
污泥絲狀膨脹：由于絲狀細(xì)菌極度生長引起的活性污泥膨脹。
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環(huán)境微生物學(xué)(名詞解釋)2017-04-09 12:43 | #2樓
1. Microorganism
The word microbe (microorganism) is used to describe an organism that is so small that, normally, it cannot be seen without the use of a microscope. Viruses, bacteria, fungi, protozoa and some algae are all included in this category.
2. Coliform group
The Coliforms are defined as facultatively anaerobic, gram-negative, nonspore-forming, rod-shaped Bacteria that ferment lactose with gas formation within 24 hours at 37℃. The Coliform group includes the organism Escherichia coli, Citrobacter, Klebsialla pneumoniae, Enterobacter aerogenes.
3. Activated sludge
Activated sludge: it is consisted of many kinds of aerobic microbe, facultative microbe and other inorganic matter. It is also known as the bacteria rich floc.
4. Biodegradability
Biodegradability refers to the transformation performance from macromolecular organisms to small molecule compounds with the help of microorganisms.
5. Bioremediation
Bioremediation is a treatment process that uses naturally occurring microorganisms to degrade hazardous substances into less toxic or nontoxic substances.
6. Eutrophication
Eutrophication is a process whereby water bodies, such as lakes, estuaries, or slow-moving streams receive excess nutrients that stimulate excessive plant growth (algae, plankton).
7. Spore
Certain species of bacteria produce special structure called endospores(內(nèi)生孢子). They are very resistant to heat and can not be destroyed easily, even by harsh chemicals. Endospores are also resistant to other harmful agents such as drying, radiation, acids and chemical disinfectants(化學(xué)消毒劑).
8. Climax
Succession ends when a relatively stable assemblage of populations, called climax community.
9. Growth curve of bacteria
If the liquid medium supplies all nutrients required for growth and environmental parameters are optimal, the increase in numbers of bacterial mass can be measured as a function of time to obtain a growth curve. Several distinct growth phases can be observed within a growth curve. These include the lag phase, the log phase, the stationary phase and the death phase.
10. Continuous culture
Continuous culture is a system that is designed for long term operation because it is an open system with a continuous feed of influent that contains nutrients solution and substrate, as well as a continuous drain of effluent solution that contain cells, metabolites, waste products and any unused nutrients and substrate.
11. Genetic recombination
Genetic recombination is the process by which genetic elements contained in two separate genomes are brought together in one unit.
This mechanism may enable the organism to carry out some new functions and result in adaptation to changing environments.
Genetic recombination usually involves much larger changes. Entire genes, sets of genes, or even whole chromosomes, are transferred between organisms.
12. Transformation
Transformation is the uptake by a cell of a naked DNA molecule or fragment from the medium and the incorporation of this molecule into the recipient chromosome in a heritable form.
13. Nutrient
Substances used in biosynthesis and energy production and therefore are required for microbial growth.
14. Culture media
Culture media are needed to grow microorganisms in the laboratory and to carry out specialized procedures like microbial identification(微生物鑒定), water and food analysis, and the isolation of particular microorganisms(特定微生物的分離). A wide variety of media is available for these and other purposes.
15. Respiration
Respiration is an energy-yielding process in which the acceptor is an inorganic molecule, either oxygen.
16. Fermentation
Fermentation may be defined as an energy-yielding process in which organic molecules serve as both electron donors and acceptors.
17. Anaerobic respiration
Anaerobic respiration is the process of ATP production by electron transport in which the terminal electron acceptor is an exogenous, oxidized inorganic molecule other than O2. The most common acceptors are nitrate, sulfate, and CO2.
18. Feedback inhibition
The end product of the pathway often inhibits this regulatory enzyme(調(diào)節(jié)酶), a process known as feedback inhibition(反饋抑制). Feedback inhibition ensures balanced production of a pathway end product. If the end product becomes too concentrated, it inhibits the regulatory enzyme and slows its own synthesis. As the end product concentration decreases, pathway feedback inhibition automatically matches end product supply with the demand.
19. Viruses
Viruses are defined as small, Obligate(專性自養(yǎng)), intracellular parasites(胞內(nèi)寄生), meaning that they require a host cell for their growth and replication(復(fù)制). Although viruses can survive outside a host(宿主), their numbers cannot increase without a host.
20. Lysogeny
Some phages can incorporate(結(jié)合) their DNA into the host cell’s DNA. The phage remains latent(潛在的) and does not cause lysis of the host cell. Such a state is
called lysogeny.
21. Colony
A cluster or assemblage of microorganisms growing on a solid surf-ace such as the surf-ace of an agar culture medium, the assemblage often is directly visible, but also may be seen only microscopically.
22. Capsule
Many prokaryotic organisms secrete on their surf-aces slimy or gummy materials. A variety of these structures consist of polysaccharide, and a few consist of protein. The terms capsule(莢膜) and slime layer are frequently used to describe polysaccharide layers.
23. Sterilization
Sterilization is the process by which all living cells, viable spores, Viruses, and viroids are either destroyed or removed from an object or habitat.
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